Hunter-nin (np. 追い忍, Oinin?, dosłownie myśliwi ninja) są to shinobi, którzy mają za zadanie odnalezienie, zamordowanie i pozbycie się ciał zbiegłych missing-ninów (zwykle nie mają oni woli powrotu do wioski). Zadanie to ułatwia im specjalne przygotowanie obejmujące perfekcyjną znajomość ludzkiego ciała (w przeciwieństwie do medic-ninów pomaga im ona w zabijaniu). Ciała zwykle są palone lub pozostawiane na pożarcie drapieżnym ptakom.

Plusy:
-Dodatkowe 10 pkt do siły
-Ceny w sklepie z bronią są tańsze o 40% a w sklepie z artefaktami są tańsze o 20% z tą specializacją